ความเป็นมาของภาควิชาเศรษฐศาสตร์เกิดขึ้นพร้อมกับคณะเศรษฐศาสตร์และบริหาร ธุรกิจซึ่งเป็นหนึ่งในสี่คณะแรกของมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ ซึ่งประกอบด้วยคณะเกษตร คณะสหกรณ์ คณะวนศาสตร์ และคณะประมง ได้เริ่มดำเนินการตั้งแต่วันสถาปนามหาวิทยาลัย.
2 กุมภาพันธ์ พ.ศ.2486 เป็นต้นมาโดยมีชื่อว่า “คณะสหกรณ์” สถานที่ตั้งเดิมอยู่ในอาคารส่วนหนึ่งของกรมสหกรณ์ ซึ่งอยู่ติดกับวังพระองค์เจ้าจุลจักรพงศ์ ท่าเตียน กรุงเทพมหานคร การศึกษาของคณะสหกรณ์ในสมัยแรกๆ นี้ มีแผนกวิชาอยู่ 4 แผนกด้วยกัน
(1) แผนกวิชาเศรษฐศาสตร์และสังคมศาสตร์
(2) แผนกวิชาสหกรณ์
(3) แผนกวิชาบัญชี และ
(4) แผนกวิชานิติศาสตร์
2495 ได้มีการเสนอให้เปลี่ยนชื่อเป็นคณะเศรษฐศาสตร์สหกรณ์เพื่อให้การศึกษา กว้างขวางมากขึ้น และเพื่อให้นิสิตมีตลาดที่จะออกไปทำงานได้มากยิ่งขึ้น แต่จอมพล ป.พิบูลสงคราม นายกรัฐมนตรีและเป็นประธาน ก.พ. ในขณะนั้นได้เน้นความสำคัญของสหกรณ์มากจึงให้ใช้ชื่อว่า “คณะสหกรณ์และเศรษฐศาสตร์” เมื่อ มิถุนายน พ.ศ.2495 พร้อมทั้งได้มีการปรับปรุงชื่อแผนกวิชาเศรษฐศาสตร์และสังคมศาสตร์ เป็นแผนกวิชาเศรษฐศาสตร์ในช่วงเวลาเดียวกัน.
ต่อมาเมื่อ พฤษภาคม พ.ศ.2499 ได้มีการเปลี่ยนชื่อคณะอีกเป็น “คณะเศรษฐศาสตร์สหกรณ์” และได้ย้ายมาอยู่รวมกับคณะอื่นๆ ที่บางเขน เมื่อภาคปลาย ปีการศึกษา 2499 – 2500
ในปี พ.ศ.2509 ได้มีการเปลี่ยนชื่อคณะอีกครั้งหนึ่งเป็น “คณะเศรษฐศาสตร์และบริหารธุรกิจ”โดยเพิ่มวิชาขึ้นอีกหลายแขนงเพื่อให้สอด คล้องกับการพัฒนาเศรษฐกิจและสังคมของประเทศ และเป็นการเปิดโอกาสให้นิสิตได้ศึกษาวิชาต่างๆ กว้างขวางขึ้นอีกด้วย โดยที่แผนกวิชาเศรษฐศาสตร์ได้เป็นแผนกวิชาหนึ่งของคณะนี้มาตลอด ในปี พ.ศ.2511 ได้มีการปรับปรุงพระราชบัญญัติมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ ขึ้นใหม่ เพื่อให้มหาวิทยาลัยมีความคล่องตัวในการบริหารการศึกษาให้กว้างขวางยิ่งขึ้น จึงได้เปลี่ยนฐานะของแผนกวิชาต่างๆ ในมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ (ซึ่งรวมทั้งแผนกวิชาเศรษฐศาสตร์ด้วย) ขึ้นเป็น “ภาควิชา” ตามประกาศสำนักนายกรัฐมนตรี ลงวันที่ 8 มกราคม พ.ศ.2512 ภาควิชาเศรษฐศาสตร์จึงกลายเป็น 1 ใน 6 ภาควิชา ของคณะเศรษฐศาสตร์และบริหารธุรกิจ ซึ่งประกอบด้วยภาควิชาเศรษฐศาสตร์ การตลาด บัญชี เศรษฐศาสตร์เกษตร สหกรณ์ และบริหารธุรกิจ
ในเดือนธันวาคม พ.ศ.2535 ได้มีการแบ่งส่วนราชการของคณะเศรษฐศาสตร์และบริหารธุรกิจออกเป็น 2 คณะ คือ คณะเศรษฐศาสตร์ และคณะบริหารธุรกิจ โดยภาควิชาเศรษฐศาสตร์ ได้สังกัดในคณะเศรษฐศาสตร์มาจนกระทั่งปัจจุบัน
รายนามผู้ดำรงตำแหน่งหัวหน้าภาควิชาเศรษฐศาสตร์ ตั้งแต่อดีตจนถึงปัจจุบัน